Obszar funkcjonowania Szczecińskiej Kolei Metropolitalnej zostanie podzielony na dwie strefy: A - na terenie Szczecina oraz gmin: Dobra, Kołbaskowo, Police i Goleniów na trasie Osiedle Kasztanowe - Załom Leśna oraz B - obejmującej Stargard wraz z terenem gminy oraz gminy: Goleniów, Gryfino i Kobylanka.
Strefowe bilety miesięczne będą uprawniały do przejazdu w danej strefie pociągami SKM i komunikacją miejską. W zależności od potrzeb będzie można kupić bilet na strefę A, B, AB (na trasie ze Szczecina do jednego z pozostałych miast) lub AB+ obejmujący wszystkie strefy. Ceny biletów normalnych będą kształtować się następująco:
- Strefa A - 152 zł
- Strefa B - 148 zł
- Strefa AB - 250 zł
- Strefa AB+ - 290 zł
W ramach Szczecińskiej Kolei Metropolitalnej będą funkcjonowały linie:
- S1 - Szczecin - Stargard
- S2 - Szczecin - Goleniów
- S3 - Szczecin - Gryfino
Na początku 2026 roku ma zostać uruchomiona linia S4 na trasie Szczecin - Police, która wciąż jest w fazie budowy.