Ekspozycja MCN składa się z wystawy stałej, wystawy czasowej i planetarium ze sferyczną salą kinową. Wystawa stała podzielona jest na pięć wystaw tematycznych, na których znajdziemy w większości interaktywne eksponaty. Są tutaj także liczne pamiątki związane z morzem, m.in. słynny kajak "Olo", którym Aleksander Doba pokonał trzykrotnie Atlandyk czy łódka "Show Must Go On", na której Agnieszka Skrzypulec i Jolanta Ogar zdobyły srebro igrzysk olimpijskich w Tokio. Łącznie na wystawie stałej dostępnych jest ponad 200 interaktywnych eksponatów, m.in. żaglówka, w której można nauczyć się halsowania, różne rodzaje żagli, bocianie gniazdo, makieta polskiego batyskafu Meduza II, fragment burty statku, o którą można rozbić butelkę wzorowaną na butelce szampana, zostając matką chrzestną jednostki. Jest także poruszająca się makieta kambuza, w której zadaniem jest "ugotować obiad" dla załogi czy pokład statku, który należy umyć.
